Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm2aP59997 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm2aP59997 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms