Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmod1P49813 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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