Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psen1P49769 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psen1P49769 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psen1P49769 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms