Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GastP48757 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GastP48757 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GastP48757 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GastP48757 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GastP48757 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GastP48757 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GastP48757 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GastP48757 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GastP48757 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GastP48757 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GastP48757 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GastP48757 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GastP48757 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GastP48757 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GastP48757 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GastP48757 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GastP48757 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GastP48757 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GastP48757 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GastP48757 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GastP48757 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GastP48757 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GastP48757 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GastP48757 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GastP48757 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GastP48757 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146 ms