Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb41P48193 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb41P48193 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb41P48193 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb41P48193 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms