Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf1P46099 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf1P46099 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms