Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rom1P32958 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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