Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms