Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp1P29452 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp1P29452 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp1P29452 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp1P29452 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp1P29452 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp1P29452 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms