Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms