Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm3P21107 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms