Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhoP15409 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhoP15409 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RhoP15409 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RhoP15409 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhoP15409 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhoP15409 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhoP15409 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhoP15409 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RhoP15409 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhoP15409 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhoP15409 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhoP15409 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhoP15409 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhoP15409 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhoP15409 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms