Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxb3P09026 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxb3P09026 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxb3P09026 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb3P09026 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb3P09026 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms