Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx8O88983 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx8O88983 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx8O88983 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx8O88983 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms