Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnabL7MTU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms