Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm8356J3QPD3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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