Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm20828J3KMI7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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