Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms