Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rfx7F8VPJ6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms