Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms