Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdh18E9Q9Q6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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