Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms