Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b2E9Q3E1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms