Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc8E9PWG2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms