Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms