Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms