Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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