Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms