Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Nup160Q9Z0W3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup160Q9Z0W3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms