Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept6Q9R1T4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept6Q9R1T4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept6Q9R1T4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms