Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cry2Q9R194 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms