Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Gpc1Q9QZF2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gpc1Q9QZF2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Gpc1Q9QZF2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Gpc1Q9QZF2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Gpc1Q9QZF2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gpc1Q9QZF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gpc1Q9QZF2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gpc1Q9QZF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc1Q9QZF2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpc1Q9QZF2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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