Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpastQ9QYY8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpastQ9QYY8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpastQ9QYY8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpastQ9QYY8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpastQ9QYY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpastQ9QYY8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms