Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms