Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms