Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col5a3Q9JLI2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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