Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod4Q9JLH8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod4Q9JLH8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod4Q9JLH8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod4Q9JLH8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod4Q9JLH8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod4Q9JLH8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmod4Q9JLH8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod4Q9JLH8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod4Q9JLH8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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