Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgn5Q9JL35 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.1 ms