Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms