Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.7 ms