Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl28Q9JIL2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms