Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms