Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox9Q9EQM5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms