Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ergic1Q9DC16 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic1Q9DC16 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms