Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms