Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrpraQ9DBG7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms