Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3bQ9DA80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3bQ9DA80 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms