Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KnstrnQ9D9Z1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KnstrnQ9D9Z1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KnstrnQ9D9Z1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms