Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp2c55Q9D816 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2c55Q9D816 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms