Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med8Q9D7W5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med8Q9D7W5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms